Метод бисульфитного секвенирования с уменьшенной репрезентативностью - это экономичное решение для проведения анализа метилирования генома позвоночных с разрешением в 1 нуклеотид. Принцип метода основан на фрагментации генома рестриктазой MspI (сайт CCGG) после проведения стадии обогащения по размеру фрагментов (size selection), для получения библиотеки, обогащенной CpG-регионами, включая промоторы и CpG-островки - целевыми фрагментами метилирования.
Для работы требуется от 25 до 100 нг ДНК Формат набора: 24 или 96 реакций Мультиплексирование: с использованием специальных уникальных двойных индексов (UDI)* Удаление ПЦР-дуплексов: с использованием уникальных идентификаторов (UMI)*
В состав набора входят все необходимые реагенты для приготовления библиотеки. * наборы индексов для мультиплексирования заказываются отдельно
C02030040 Premium Methyl UDI-UMI Adapters Module - Set A C02030041 Premium Methyl UDI-UMI Adapters Module - Set B Адаптеры Methyl UDI-UMI Adapters Module - полноразмерные адаптеры с уникальными двойными индексами (UDI) и уникальными молекулярными идентификаторами (UMI) для мультиплексирования библиотек, полученных в результате использования набора Premium RRBS kit V2 и прочих приложений для бисульфитного секвенирования.
Настоятельно рекомендуется использовать UDI (уникальные штрих-коды i5 и i7) для уменьшения ошибок, связанных с неправильным чтением. Использование UMI (9-базовый) настоятельно рекомендуется для количественного анализа или обнаружения низкочастотных вариантов.