Исходный биоматериал: до 50 000 клеток на реакцию. ATAC-seq (от англ. Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) — метод для полногеномного оценивания степени открытости хроматина. Технология основана на использовании транспозазы Tn5, которая разрезает открытый хроматин и одновременно лигирует адаптеры для последующей амплификации и секвенирования. Метод ATAC-seq используется для:
Выявления открытых участков хроматина;
Определения положения нуклеосом с разрешением в один нуклеотид;
Выявления участков связывания транскрипционных факторов и сайтов метилирования ДНК.
Набор ATAC-seq оптимизирован для работы с 50 000 клеток на реакцию. В состав набора входят реагенты для лизиса клеток и выделения ядер, тагментации и очистки ДНК, а также для амплификации библиотек. Адаптеры для мультиплексирования не входят в состав набора и приобретаются отдельно.